在上级有关部门的直接指导下，东航经过对“3·31”返航事件认真调查，本着“实事求是、依法依纪严肃处理”的原则，对所认定的11次人为返航的13名飞行人员进行了严肃处理。对在返航事件中情节较重的1名机长停飞，给予开除党籍处分；3名飞行教员分别停飞一至两年，给予留党察看处分。对于另外2名飞行教员和2名机长，分别取消教员和机长资格、降为副驾驶，并给予党内严重警告或警告处分。其他5名参与返航情节较轻的飞行人员也已暂停飞行，经教育整顿和严格检查后重新认定从业任职资格。针对此次事件暴露出的管理问题，东航严肃追究了8名相关领导人员的责任。对云南分公司总经理、党委书记和分管副总经理给予党内警告处分，两名主要领导免去原任职务；对云南分公司飞行部、相关飞行分部5名领导人员分别给予党内严重警告或警告处分，其中4人免去职务。

与此同时，东航集团公司党组按照中央领导指示，贯彻国务院国资委党委的部署，在广大党员中认真开展了以“共产党员和中央企业在抗震救灾中的义务和责任”为主题的专题组织生活，充分运用抗震救灾中涌现出的先进事迹和“3·31”返航事件的深刻教训进行正反两方面教育。在抗震救灾斗争中，东航是反应最迅速、前期投入运力最多的航空公司，所派出的东航直升机队伍成为进入灾区最早、运送救灾物资最多的民航直升机救援队伍。由于东航出色完成各项抗震救灾任务，受到了国务院国资委、民航局及地方政府的充分肯定。东航有3家单位被中华全国总工会授予首批抗震救灾重建家园“工人先锋号”荣誉称号，有6家单位、13名个人被推荐为全国民航抗震救灾先进典型。东航集团公司对39个先进集体和90名先进个人进行了表彰。

结合弘扬抗震救灾精神和深入反思“3·31”返航事件的教训，东航要求各级领导干部以飞行队伍为重点，深入开展谈心活动，增强大局意识和责任意识，加强飞行人员的法制观念和职业道德教育。在东航云南分公司，东航集团领导和分公司领导班子成员，分别与飞行部门管理干部及参与返航事件的飞行员进行谈心，使他们深刻认识返航事件造成的恶劣影响和严重后果，自觉维护企业稳定大局。同时，云南分公司党委还结合实际开展了“当一个合格的管理者、做一名合格的共产党员”的“双合格”活动，以多种形式加强队伍建设。

东航表示，将认真吸取返航事件的深刻教训，切实加强员工队伍管理，进一步鼓舞士气、坚定信心，把抗震救灾精神转化为办好奥运会的实际行动，通过深入开展“安全、正常、优质服务年”和“金牌服务迎奥运”等活动，全力以赴为北京奥运会的成功举办提供安全优质的保障。